这场简单的军事会议并没有商量出什么结果，在敌强我弱，兵力悬殊的情况下，杨复生只能先选择守势，寻找阴世师的破绽再进攻反攻，就目前人言，杨复生还需要等待。
会议在小半个时辰后结束，众人各自散去，杨复生这才回去安歇，在屋子里，摆放着一个沙盘，上面标明了武功县城与阴世师驻地的所在，杨复生默默看了好一会，这才回去休息。
官军方面，阴世师回到大营之后，立刻做出了下一步的部署，三军士兵四处搜寻，找到了附近尚未逃走的百姓，阴世师征用了其中身强力壮的男丁，令他们带上农具、工具，在附近挖掘着泥土、灰石等物。
阴世师打算毕其功于一役，次日依旧没有进攻，而是继续挖掘，征集起来的民夫足有千人，他们在官军的看管下，只得卖命挖掘泥土，用了五日的功夫，挖掘出来的泥土堆积如山，全部放在手推车上，阴世师是打算一下子就把护城河给填平。
第六日，阴世师在天色不亮之前，就让三军起来，准备再度攻打武功县。
杨复生这几日也没有闲着，他早就知道阴世师在准备着计划，不过杨复生并不担忧，阴世师想要填平护城河，不是自己能够阻挡的，事实上，由于弓箭的射程，杨复生也无法攻击到护城河外侧。
当阴世师再度准备妥当杀来，杨复生率领着众人登上城头，观看着阴世师的行动。果然，经过了几日准备后的阴世师，一副信心满满的样子，大军在城外停下，士兵们驱赶着民夫，把一框框的烂泥、灰石倒入河中。
武功县的护城河虽说又宽又深，但如果按照这样的趋势下去，早晚都会被填平。
宽达一百多步护城河，需要用几日来填平？或许三日，或许五日。然而杨复生不可能眼睁睁地看着官军填平护城河，直到弓箭的射程内。弓箭射程不足，杨复生却还有其他办法。他很快下达了命令。
杨复生在占据武功县之后，除了修葺城池，就是操练着水师，尽管这个水师不是那么正规，无论是船只还是水师士兵的数量都很小，但用在武功县，却是足够了。
接到杨复生的命令之后，水师的士兵头准备好了，等待着时机。隋军正在忙碌着倾倒泥土，浑然没有注意到，在西边城门处，杨复生已经准备好了一切，只是在等待着机会。
民夫卖力地干了一早上，南门外的护城河被填平了大约十几步的地方，勉强进入了弓箭的射程，不过这还不够，弓箭过去，必然没有什么力道，对敌人没有威胁。就算是放置投石车，也没有什么用，毕竟这一块地方刚刚填平，泥土还十分松软，如果放置了投石车，在抛射圆石的的时候，投石车很容易陷入淤泥中。所以阴世师决定继续填平护城河，直到距离城墙五十步左右，才可停下。